Illumina和PacBio两位CEO对话未来

2018-11-18 20:52:53

来源:高通量测序


近日,Illumina宣布它计划以12亿美元的现金收购Pacific Biosciences。消息宣布后,这两家公司的CEO–Illumina的Francis deSouza和PacBio的Mike Hunkapiller–在电话会议上介绍了一些细节并回答了一些问题。


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Illumina公司的CEO Francis deSouza


deSouza在他的开场白中说:“从以往来说,长读长技术面临的挑战是准确性和成本。然而,PacBio最近的技术突破已经证明了长读长有着无以伦比的准确性,再加上即将发布的8M Smart Cell,这将大大提高该技术的实用性和经济性。”


在回答“为什么是现在”的问题时,deSouza强调Illumina一直在关注长读长市场,而PacBio最近的试剂和软件更新提供了时机。“坦率地说,PacBio在过去几个月有了激动人心的创新,他们能够大大提高其产品的准确性,以及测序仪的总产量,”deSouza说。他表示,Illumina迅速采取行动,而这个过程并不存在竞争。


组合优势


两位高管都盛赞了对方的团队和文化。“作为此次收购的一部分,我们感到特别兴奋的一件事情就是拥有一支很有才华的技术团队。这支技术团队拥有大量的单分子专业知识,包括纳米孔知识,”deSouza谈道。


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PacBio公司的CEO Mike Hunkapiller


Hunkapiller则认为两家公司能够轻松整合。“我们有着相似的文化,这将使我们能够快速整合,并继续实现我们的技术路线图,从而大大拓宽我们互补长读长平台的机会,”他说。


关键词是互补


这项交易预计在2019年年中完成,具体时间取决于全球监管部门的审批。Illumina在今年早些时候收购了Edico Genome,如今是测序市场上最大的参与者;而PacBio则是第二大的参与者,但两位高管都反复强调,两家公司拥有互补技术,并非竞争。


deSouza表示:“我们是最大的参与者,我们服务于短读长测序市场。这个细分市场与长读长参与者所服务的细分市场是互补的。坦率地说,我们并没有真正参与长读长测序市场。以de novo测序为例,那真的非常适合长读长的参与者。”他再次强调:“PacBio不会参与短读长市场的竞争;我们也不会参与长读长市场的竞争。”


Illumina认为,短读长和长读长技术都是市场所需要的。“我们相信有一些临床应用,需要用到长读长技术。例如,有些疾病是由结构变异引起的,这只能通过长读长技术来诊断,”deSouza说。他还提到了组织分型和药物基因组学。


“我们认为,利用SBS短读长技术和PacBio长读长技术完成全基因组测序的成本差距将继续存在,”deSouza谈道。“从市场的角度来看,我认为这样很好。考虑到利用长读长技术所获得的东西,市场可以接受。”


首要任务


在被问及整合平台时,也就是在同一台仪器上对短读长和长读长进行测序,deSouza将话题转到了数据。他认为数据整合是首先要做的事。


“我们感到兴奋的事情之一是有望整合两种仪器的数据,为客户带来独特的基因组视图。如今,客户必须手动将它们拼接在一起,以获得他们想要的见解。我认为,如果他们能够自动获得,那无疑将有很大帮助。通过这种组合,我们将能够做到这一点,”deSouza说。


Hunkapiller也表示同意。他说:“对于那些未必有丰富信息学知识的人来说,这真的很有吸引力,因为它让数据集的整合变得更容易。这无疑是将我们组合在一起的关键因素。”


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